多くの来訪者が期待を寄せるのが、館内にあるギフトショップでの買い物です。現在、ショップの利用は見学ツアー参加者のみに限定されており、転売対策として厳格な入場管理と購入制限が敷かれています。
店頭における目玉は、ここでしか手に入らない山崎蒸溜所限定ウイスキー（300mlボトル）や、蒸溜所のロゴ入りテイスティンググラス、樽材をアップサイクルした家具やステーショナリーなどの限定グッズです。一人あたりの購入本数は厳しく制限されているものの、現地を訪れた証として高い満足度を誇っています。
一方で、市場価格が高騰している「山崎12年」の定価購入に関しては、日によって入荷状況が大きく変動します。毎ツアー必ず店頭に並ぶわけではなく、当日の製造出荷スケジュールや在庫状況に応じた不定期販売となっているのが実情です。巡り合えた場合はまさに幸運と言えますが、限定ボトルやオリジナルグッズを含めた幅広いラインナップも十分に魅力的な構成となっています。
