「普段使っているSuicaに十分な残高があるから大丈夫」と新幹線の改札へ直行するのは禁物です。結論から言うと、完全な事前登録なしの状態でタッチして乗れるケースは極めて限定的です。
新幹線の改札で扉が閉まる最大のSuica 新幹線の改札エラーの理由は、利用したい新幹線サービスに対してSuicaの番号(JEから始まるID番号)が紐付いていないか、チャージ残高が不足していることにあります。在来線とは異なり、新幹線は「特急料金」が発生するため、どの区間をどの席種で乗るのかをシステム側が認識できなければ改札を通過できません。
特に注意したいのが、東京駅を境にした管轄の違いです。東北・上越・北陸新幹線などのJR東日本区間と、東海道新幹線などのJR東海区間では、乗車に必要なWebサービスや設定方法がまったく異なります。まずは自分が「どの路線の、どの座席(自由席・指定席)に乗るのか」を明確にすることが失敗を防ぐ第一歩です。