静岡空港最大のミステリーとして語られ続けるのが、「空港の真下を東海道新幹線が通過しているのに、なぜ駅ができないのか」という疑問です。滑走路直下の牧之原トンネルを新幹線が貫く立地は、世界的に見ても極めて稀な構造。静岡県側は長年、新駅設置を要望し続けていますが、構想が具現化しない背景には3つの決定的な理由が存在します。
第1の理由は、東海道新幹線の極限まで過密なダイヤ密度です。東京〜新大阪間を結ぶ日本の大動脈では、ピーク時に1時間あたり10本以上の「のぞみ」が運行しています。静岡空港新駅に各駅停車の「こだま」を停車させた場合、本線上で後続の高速列車を退避させる設備や加減速のタイムロスが生じ、過密ダイヤ全体の運行管理に甚大な影響を及ぼす懸念があります。
第2の要因は、巨額の建設費用と採算性のハードルです。トンネル区間に新駅を開設・整備するには数百億円規模の工費が必要と試算されています。JR東海側としては、既存の掛川駅（約15km西）や静岡駅との距離が近く、莫大な投資に見合う需要創出が見込めないという現実的な判断を下しています。
第3に、リニア中央新幹線を巡る議論との兼ね合いが挙げられます。県とJR東海の協議において、南アルプストンネル工事問題と並行して新駅設置が取り沙汰される局面もありましたが、鉄道事業としての純粋な運行合理性の観点から、早期着工への合意形成は極めて困難な状況が続いています。
