ゴーヤの花を観察する際、まず見るべきは花びらそのものではなく「花の根元」です。雄花と雌花には、受粉前から歴然とした構造の違いが存在します。
最大の特徴は、雌花の根元に最初から「小さなゴーヤの形をしたふくらみ（子房）」がついている点です。開花前の小さな蕾の段階であっても、イボイボとした小さな緑色のふくらみがあれば、それは間違いなく雌花です。花の中央を覗き込むと、めしべの先（柱頭）が淡い緑色〜黄色をしており、花粉はついていません。
対する雄花は、細い茎（花柄）の先に直接花びらが開いており、根元にふくらみは一切ありません。花の中央部には黄色い花粉をたっぷりまとった「おしべ」が存在し、指で触れると黄色い粉が付着します。この構造上の違いさえ把握しておけば、見間違うことはまずありません。
