訪れる観光客の急増は経済効果を生む一方で、違法駐車やゴミ問題、撮影時のマナー問題といったオーバーツーリズムの課題も浮き彫りにした。これに対し、行政側である滋賀県高島市役所は、地域交通の円滑化と環境保全を両立させるため、警備員の配置や臨時駐車場の整備を迅速に推進している。
また、びわ湖高島観光協会は、持続可能な観光地づくりに向けた地方創生事業を精力的に展開中だ。単なる通過型の観光スポットで終わらせるのではなく、近隣のヴォーリズ建築群や琵琶湖のアクティビティと連携した滞在型ツアーの企画など、地域全体へ周遊を促す仕組みづくりが進められている。景観を守りながら地域経済を潤す試みは、全国の観光都市からも熱い視線を浴びている。