私立の医療系・薬系大学に進学する際、家庭にとって最大の懸念材料となるのが学費です。福岡国際医療福祉大学の学費は、医療系学部で初年度約150万〜180万円、6年制の薬学部では初年度約200万円前後と、私立医療系としては標準的な設定となっています。
しかし、特筆すべきは返済不要の「特待生制度」や独自の奨学金制度が極めて充実している点です。入試成績優秀者を対象とした特待生制度では、最大で授業料の全額免除または半額免除が適用されます。この制度を活用することで、国公立大学並み、あるいはそれ以下の学費負担で6年間または4年間の学びを修めることが可能になります。
さらに、グループ病院での一定期間の勤務を条件に学費相当額が貸与・返還免除される「グループ病院奨学金」など、経済的自立を目指す学生をバックアップする重層的なセーフティネットが敷かれています。