受診者を最も恐怖に陥れるのが、「治療前より肌が汚くなった」「赤みが半年経っても消えない」という悪化トラブルです。医療事故調査関連の知見や美容皮膚科のトラブル相談データによると、失敗とされる現象の約8割は「炎症後色素沈着（PIH）」と「未熟な組織への過剰照射」に起因しています。
アジア人の肌は欧米人と比較してメラノサイトの活性が高く、熱刺激に対して過剰なメラニンを生成しやすい遺伝的特性を持っています。特にフラクショナルCO2レーザーのように表皮を蒸散（熱で削る）させる高出力レーザーを用いた場合、照射後の皮膚は重度の熱傷を負った状態と同じです。この脆弱な肌に対して、遮光対策を怠ったり、マスクの擦れなどの機械的刺激を与えたりすると、瞬く間に赤み色素沈着として定着してしまいます。
もう一つの深刻な要因は、利益を優先する一部クリニックにおける「照射パラメータ設定の形骸化」です。肌質や皮膚の厚み、ニキビ跡の重症度を医師がミリ単位で診断せず、マニュアル一辺倒で出力を上げすぎた結果、真皮層の瘢痕化を招いて凸凹が余計に不自然になったり、ビニール肌と呼ばれる菲薄化（ひはくか）を引き起こしたりする事例が報告されています。症例写真ビフォーアフターの華やかな宣伝文句に惑わされず、肌トラブルのリスクをカウンセリング時に包み隠さず説明する医師を見極めなければなりません。
