「なぜ学習院や中央、日本大学ではなく、この6校だったのか？」という疑問には、日本野球黎明期の劇的な人間ドラマと力学が隠されています。その発端は、1903年（明治36年）に始まった伝統の早慶戦にまで遡ります。
当時、日本中を熱狂させた早慶戦ですが、応援団同士の対立がエスカレートし、1906年に暴動寸前の事態へと発展。大学当局によって試合が無期限中止に追い込まれてしまいます。この膠着状態を打開し、健全な対戦環境を再構築するために動いたのが明治大学でした。1914年に明治が早慶の間を取り持つ形で「三大学リーグ」を結成し、1917年には法政大学、1921年には立教大学が相次いで合流します。
そして1925年（大正14年）秋、最大の転機が訪れます。官学の最高峰であった東京帝国大学（現・東京大学）の加盟です。東大の参戦によってリーグの社会的信用と格式は決定的なものとなり、中止から実に19年の歳月を経て早慶戦が正式に復活を遂げました。この瞬間、現在の東京六大学野球連盟の歴史と経緯が名実ともにスタートを切ったのです。
翌1926年には、現在の聖地である明治神宮野球場が竣工。当時、他の大学（中央大学や日本大学など）も加盟を模索した記録が残されていますが、すでに6校による総当たり対戦の日程消化が限界に達していたことや、先行加盟校による排他的な空気感も影響し、新たな参入は締め切られました。結果として、1931年に日本大学や中央大学、専修大学などは「東都大学野球連盟」という独自の連盟を立ち上げることになります。つまり、あの6校が選ばれたのは、偏差値の序列ではなく、大正時代のグラウンドで繰り広げられた対抗戦の成立プロセスそのものが理由だったのです。
