地下1階と地下2階で明確に役割が分けられているのが、ブックファースト新宿店のフロアマップの特徴です。事前に各階の特性を把握しておくことで、広大なフロアで迷うことなく目当ての書籍に到達できます。
地下1階(B1F)は、最新トレンドと日常の知的好奇心を刺激するフロアです。話題の新刊・ベストセラーはもちろん、文芸書、文庫・新書、実用書(料理・健康・趣味)、雑誌類が充実しています。さらに、洗練されたセレクトが光るブックファースト新宿店の文房具売り場もこの階に位置しており、高級筆記具から日常使いのデザインステーショナリー、手帳やレターセットまで上質なアイテムが揃っています。
一方、中央のエスカレーターを降りた地下2階(B2F)は、圧巻の専門書ゾーンです。人文学、社会科学、法学、経済・経営、理工、医学、芸術、デザイン、建築、語学、学術書、そしてコミックやライトノベルに至るまで、研究機関や専門職のニーズにも応える圧倒的なストックを誇ります。静謐な空気が漂うフロア設計となっており、立ち止まってじっくりと本の頁をめくるのに最適な環境が整っています。