両者のエクササイズを決定づけるもう一つの大きな要素が呼吸法と自律神経へのアプローチです。
ヨガでは基本的に「腹式呼吸（鼻から吸ってお腹を膨らませ、鼻から吐いてお腹をへこませる）」を用います。腹式呼吸は副交感神経を優位にする働きがあり、自律神経とメンタルケア効果が非常に高いのが特徴です。日々のプレッシャーや過密なスケジュールで交感神経が高ぶり、緊張が抜けない状態にある人の心身を緩め、深いリラクゼーションと睡眠の質の改善へと導きます。
これに対してピラティスでは「胸式ラテラル呼吸（鼻から吸って肋骨を立体的に広げ、口から吐きながら肋骨を締める）」を採用します。胸式呼吸は交感神経を適度に活性化させ、頭をすっきりと覚醒させる効果があります。お腹の奥にある腹横筋や骨盤底筋群を常に引き締めた状態で呼吸をコントロールするため、体幹を強固に安定させながら安全かつ精密に動作を行える状態を作り出します。
