精液がオレンジ色に変色する直接的な要因は、大きく分けて「外来性の色素沈着」と「体内組織からの微小出血」の2系統に集約されます。
まず疑うべき無害な要因が、ビタミン剤による精液の着色です。ビタミンB2（リボフラビン）を多く含む栄養ドリンクやマルチビタミンサプリメントを摂取すると、尿が鮮やかな蛍光黄色〜オレンジ色に変わることは広く知られています。尿道内に残存した微量の尿が射精時に混ざることで、精液全体がオレンジがかって見える事例は臨床現場でも珍しくありません。
一方で、身体の異常として最も頻度の高い病態が血精液症（けっせいえきしょう）です。血精液症とは、精液の通り道である前立腺、精嚢、尿道などの粘膜血管が破綻し、血液が混入する症状全般を指します。出血量がごくわずかである場合、鮮血の赤ではなく、黄色い精液と混ざり合って鮮明なオレンジ色や錆色（赤褐色）として排出されます。
