保護者や受験生が最も注視するポイントのひとつが費用面です。EXPG高等学院で発生する学費は、「EXPG高等学院側の納入金」と「連携校であるN高等学校の学費」の合算となります。
EXPG高等学院の年間費用は、入学金・施設維持費・レッスン料などを含めて年間およそ100万円〜110万円前後が相場です。これにN高等学校の通信制授業料(年間約25万〜35万円程度)が加わるため、3年間の総額は約350万円〜400万円超を見込む必要があります。公立高校と比較すると高額ですが、通常のダンススクールへ毎日通いながら私立高校に在籍する場合と同等、あるいはそれ以上のコストパフォーマンスと捉える保護者も少なくありません。
なお、国の「高等学校等就学支援金制度」はN高等学校の学費部分に適用されるため、世帯年収に応じて一定の負担軽減が期待できます。さらに、優れた才能と熱意を認められた生徒を対象としたEXPG高等学院の特待生制度も存在します。特待生オーディションで選抜されると、学費の全額または一部が免除される特典があり、毎年ハイレベルな争奪戦が繰り広げられています。