安野モヨコを語る上で欠かせないのが、映画監督・庵野秀明氏とのパートナーシップです。2人の出会いは2000年頃、共通の知人である漫画家・ゆうきまさみ氏らを介した食事会がきっかけでした。当初は互いに異なるフィールドで多忙を極めていたものの、創作に対する深い理解と感性の共鳴から急速に距離を縮め、2002年3月に結婚を発表しました。
この異色のトップクリエイター同士の生活をユーモラスに描いたエッセイ漫画が『監督不行届』です。作中では庵野氏を「カントクくん」、自身を「ロンパース」と名付け、オタクカルチャーの頂点に立つ夫の奇想天外な生態と、それを温かく受け止めつつツッコミを入れる妻の日常が赤裸々に綴られています。
2人の間に子供はおらず、夫婦水入らずの家族構成で互いの生活と健康を支え合っています。庵野氏が『シン・エヴァンゲリオン劇場版』をはじめとする過酷な制作現場に挑む際も、安野氏の存在が精神的なアンカー（碇）となり、食事面やメンタル面で多大な支えとなっていたことは業界内でも広く知られています。
