第四次忍界大戦において、薬師カブトは名だたる忍たちを次々と穢土転生で蘇らせ戦力を増強しましたが、そこにシスイの姿はありませんでした。カブト自身が作中で「シスイの死体は見つけられなかった」と明言している通り、遺体（個人情報を含むDNA）が完全に消失していたことが蘇生されなかった決定的な理由です。
シスイが身を投げた南賀川は水流が激しく、遺体は広大な水域の深部へと流され、完全に分解・水没してしまったと考えられています。さらに、彼の万華鏡写輪眼は右目がダンゾウの自爆直前に封印・破壊され、左目はイタチが天照の黒炎でカラスごと完全に焼き尽くしたため、眼球からDNAを採取することも不可能でした。
一部のファンの間では長年「遺体が見つからないなら実は生き延びているのではないか」という生存説や、続編『BORUTO』に登場する謎の仮面の人物の正体ではないかという憶測が囁かれたこともありました。しかし、彼の死はイタチの万華鏡開眼のトリガーであり、ナルト世界の歴史を動かす不可欠な要素として公式に完結しています。死の不可逆性こそが、シスイというキャラクターの悲劇性と美しさを際立たせています。
