スカイスパ横浜の利用料金は、滞在時間に応じた明快なプラン設定がされています。基本となる「一般入浴（5時間まで）」や短時間の「スピード利用（2時間）」、時間を気にせずくつろげる「フリータイム」など、目的に合わせた選択が可能です。
少しでもお得に利用したい場合、公式アプリのポイント還元やLINE公式アカウントで不定期に配信される割引クーポン、各種提携カード（タイムズクラブカードやエポスカードなど）の優待割引をチェックするのが賢い方法です。
また、横浜駅周辺で終電を逃した際の避難場所としても重宝されています。深夜24時以降の滞在には深夜料金（割増料金）が加算されますが、翌朝までリクライニングチェアやレストルームで仮眠を取りつつ、朝サウナを浴びて出社するビジネスパーソンの姿も目立ちます。駅直結という利便性も相まって、周辺のビジネスホテルに急遽泊まるよりもリーズナブルに快適な夜を過ごせます。
