畝傍高校の進学実績を語る上で最大の特筆点は、京都大学、大阪大学、神戸大学をはじめとする近畿圏の難関国立大学への極めて高い合格比率です。公式発表資料や進路統計によると、毎年国公立大学全体へ200名を超える合格者を輩出しており、国公立志向の強さは全国の公立進学校の中でも際立っています。
特に京都大学への合格者数は毎年二桁台をコンスタントに記録し、大阪大学や神戸大学と合わせた難関3大学の合格者数は学年の上位層を厚く形成しています。これに加えて東京大学への現役合格者や、国公立大学医学部医学科への進学者も毎年着実に現れており、ハイレベルな学習環境が実証されています。
私立大学においても、同志社大学、立命館大学、関西学院大学、関西大学といった関関同立へ多数の合格実績を残しています。しかし、生徒の意識は国公立大学現役合格に強く向けられており、安易な私立専願に流れることなく、5教科7科目を最後まで粘り強く学習しきる指導体制が定着しています。
