突然の体調急変や夜間の発症時に頼りになるのが、同院の救急医療体制です。京都桂病院では救急外来（救急告示病院）として24時間365日体制で急患の受け入れを行っています。
夜間や休日に救急外来を受診する際は、来院前に必ず電話での事前連絡が必要です。当直医の専門分野や院内の受け入れ状況、重症患者の対応状況に応じたトリアージ（緊急度判定）が行われるため、緊急度が高い患者が優先して診察されます。小児の専門救急や特定疾患については、京都市内の初期急病診療所や当番医との連携体制が敷かれています。
診療科の陣容においては、日本内科学会や日本外科学会などの認定指導医・専門医が多数在籍。手術支援ロボット「ダビンチ」を用いた低侵襲手術や、カテーテルによる弁膜症治療（TAVI）、早期がんに対する内視鏡的治療など、身体への負担が少ない先進的治療を積極的に導入しています。担当医表には各医師の専門領域が明記されており、セカンドオピニオン外来も設置されています。
