三重城港内には広大な有料駐車場が整備されています。駐車場の利用料金は1日あたり500円（普通車）の一律定額制（または最初の一定時間無料枠と定額上限設定）となっており、出庫時にゲート精算機で支払います。注意点として、精算機は千円札と小銭のみ対応のゲートが多いため、事前に現金を用意しておくことが現場でのトラブルを防ぐポイントです。
港湾施設内には、乗船前の準備を整える待合所および清潔な男女別トイレ施設が配置されています。待合スペースにはベンチ、自動販売機、コインロッカーが備わっており、ダイビングやシュノーケリングの器材セッティング、ウェットスーツの着用準備などを落ち着いて行うことができます。また、ツアーから帰港した際に利用できる簡易シャワー設備（有料コイン式シャワー等）も設置されており、フライト前の着替えにも対応可能です。
