最大の違いは、「会社の合意が必要かどうか」そして「後から撤回できるかどうか」にあります。
まず「退職願」は、労働者が会社に対して「辞めたいのですが、よろしいでしょうか」と打診するための書類です。つまり、契約解除の「申し込み」に過ぎません。そのため、会社側が承諾する前であれば、原則として撤回することが可能です。「上司と話し合って引き止められ、残ることにした」というケースで使われるのは、この退職願です。
一方の「退職届」は、「○月○日をもって辞めます」という、労働者側からの「一方的な意思表示」です。こちらは届け出が会社に受理された瞬間、あるいは到達した時点で、労働契約の解除が確定します。原則として労働者側から勝手に撤回することはできません。会社側が「辞めさせない」と拒絶しても、民法の規定（退職の申し入れから2週間で契約終了）に基づき、基本的には退職が成立します。
