『振り返れば奴がいる スペシャル』を巡る最大の混乱は、「最終回で凶刃に倒れたはずの司馬がなぜ登場しているのか」という時系列の謎にあります。視聴者の間では長年、「司馬は実は生きていたのではないか」「奇跡的に一命をとりとめた続編なのではないか」という推測が語られてきました。しかし、公式設定における時系列は「本編の途中に起きた未公開エピソード」です。
具体的には、石川が自らの病魔（末期のスキルス胃癌）に侵されながらも天真楼病院で執刀を続け、司馬との対立が決定的に激化していた本編第8話から第9話前後の時間軸に位置づけられています。本編のラストで描かれた石川の病死、そして司馬が病院を去る夜に刺殺された結末そのものは微動だにしていません。
スペシャルのあらすじは、天真楼病院に持ち込まれた困難な症例と、院内にはびこる権力闘争を軸に展開します。司馬の過去を知る因縁の外科医（小峰医師／長谷川初範）が登場し、司馬の傲慢な医療方針に揺さぶりをかけます。利権と保身に走る病院幹部たちを冷淡にあしらう司馬江太郎と、患者の尊厳を守るために命を削る石川玄。二人は激しく反目しながらも、高度な医療技術が要求される緊急手術の現場において、言葉を交わさずとも互いの腕を誰よりも信頼し合っているという、皮肉で美しい共鳴を見せます。
結末のネタバレに触れると、難手術を成し遂げた司馬は再び冷酷な仮面を被り、石川は自らの信念を曲げずに病状の悪化へと向かう日常へと戻っていきます。つまりスペシャル版は、本編の悲劇的な結末を知る視聴者に対して、「二人が背中を預け合えたかもしれない唯一無二の瞬間」を提示する、極めて残酷で切ないプロローグ（間奏曲）として機能しているのです。
