由布院温泉屈指のロケーションを誇る同館の象徴が、由布岳を望む展望露天風呂です。1階の「ゆふの湯」には開放感あふれる2段式の野天風呂が備わり、2階の「あさぎりの湯」からは絵画のように広がるパノラマビューを堪能できます。朝夕で男女入れ替え制が採用されているため、1泊の滞在で趣の異なる2つの名湯を巡ることが可能です。
本格的なフィンランドサウナや水風呂も完備されており、由布岳の清らかな外気に吹かれながらの「ととのい」体験は温泉ファンから熱い支持を集めています。プライベートな湯浴みを望む方には、気兼ねなく源泉を楽しめる家族風呂（貸切温泉）も用意されており、小さな子ども連れやカップルに最適です。
宿泊だけでなく日帰り温泉としての利用も受け付けています。ゆふいん山水館の日帰り温泉料金は大人1,000円前後（フェイスタオル付・要事前確認）と利用しやすい価格帯に設定されており、観光の合間に名湯でリフレッシュしたい立ち寄り客にも親しまれています。
