1999年12月21日午後2時頃、終業式を目前に控えた京都市伏見区の日野小学校校庭で、その凶行は起きました。当時校庭で遊んでいた小学2年生の男児(当時7歳)に対し、自転車で校内に侵入してきた男が突如として刃物で襲いかかり、首などを切りつけて命を奪ったのです。周囲にいた児童たちの悲鳴が響き渡るなか、男は凶器を所持したまま自転車で逃走しました。
京都府警による特別捜査本部が設置され、現場からは犯人が残したとみられるニット帽、ジャンパー、そして不可解なメモが発見されました。目撃証言をもとに犯人の似顔絵が公開され、当時のニュース報道は連日トップニュースで犯人の行方を報じ続けました。教育の聖域と信じられていた校内へ不審者が白昼堂々と侵入した事実は、地域住民のみならず全国の学校関係者に戦慄を走らせたのです。
発生から約1か月半後の2000年2月5日、警察は現場付近に住む当時21歳の無職の男を有力な被疑者として特定し、任意の事情聴取を試みました。しかし、男は警察官の訪問直後に自宅近くの団地屋上から飛び降り自殺を図り、病院で死亡が確認されました。加害者が自ら命を絶ったことにより、法廷で京都小学生殺害事件 犯行動機が公に審理される道は永遠に閉ざされるという、極めて後味の悪い結末を迎えたのです。