再建手術が技術的に成功し、組織が肉体的に生着したとしても、患者が直面する課題は終わらない。手術後には長期間にわたるリハビリテーションと後遺症の経過観察が不可欠となる。
神経の再生には数か月から数年の歳月を要するため、知覚麻痺や異常感覚が生じることが少なくない。また、勃起障害（ED）や尿道狭窄による排尿障害など、日常生活に直結する後遺症への対策が必要とされる。泌尿器科学と形成外科が連携し、薬物療法や二次的な形成手術、さらには精神的なトラウマに対するメンタルヘルスケアを包括的に提供することが回復への鍵となる。
