旅の楽しみである「食」に関しても、長崎空港のクオリティは突き抜けている。3階のレストランフロアには、創業以来の伝統を誇る名店がひしめき、濃厚なスープと山盛りの具材が特徴の長崎ちゃんぽんや、芳ばしい香りが食欲をそそる皿うどんを味わうことができる。地元の新鮮な魚介を使った海鮮丼や、長崎和牛のステーキを提供する店舗も連日賑わいを見せている。
土産物エリアに目を向けると、長崎カステラの老舗各社がズラリと店を連ねる。ここでは定番商品だけでなく、空港限定パッケージや焼き立ての生カステラなど、ここでしか手に入らないプレミアムな逸品が並ぶ。出張帰りのビジネスマンが手早く買い求める姿から、じっくり味わい比べる観光客まで、常にお買い物を楽しむ熱気に包まれている。