公共交通機関を利用したアクセスは非常にスムーズです。最寄り駅となる東京メトロ半蔵門線・都営大江戸線「清澄白河駅」のA3出口から地上へ出ると、徒歩約3分で資料館の建物に到着します。
駅から資料館へと続く「深川資料館通り商店街」は、約800メートルにわたって個性豊かな個人商店や飲食店、古書店が並ぶ下町情緒あふれるストリートです。近年ではリノベーションされたコーヒースタンドやベーカリー、クラフトショップが次々とオープンし、昔ながらの商店街の温かさとモダンなカルチャーが見事に調和した散策エリアとなっています。
