『ゴジラvsデストロイア』のクライマックスは、シリーズ屈指のドラマツルギーと悲壮美に満ちています。ゴジラの体内炉心が1200℃に達した時、想定される最悪のシナリオは2つありました。ひとつは地球全体の大気を焼き尽くす「大気引火」、もうひとつは超高熱の核物質が地球の核へと沈降していく「チャイナ・シンドローム（メルトダウン）」です。
人類側の防衛組織Gフォースは、最新鋭戦闘機「スーパーXIII」や冷凍レーザー戦車を総動員し、東京臨海部で暴走するゴジラへ極低温冷却攻撃を敢行。これによって地球規模の壊滅的爆発こそ免れたものの、バーニングゴジラの最期は避けられませんでした。全身の骨肉が融解し、真っ赤な閃光と濃密な放射能ガスを放ちながら崩れ落ちていくシーンは、映画史に残る屈指の名場面です。
しかし、ゴジラvsデストロイアの結末は絶望だけで終わりません。直前にデストロイアによって倒されていた「ゴジラジュニア」の亡骸が、親ゴジラから放出された莫大な放射エネルギーを全身に吸収。死の淵から蘇生を遂げると同時に急速変態を遂げ、立ち込める放射能霧の中から完全な成体ゴジラとして咆哮を上げます。命のバトンが次世代へと引き継がれた瞬間でした。
