民間水族館の入場料金が2,500円〜3,000円台へと推移するなか、葛西臨海水族園の入場料は一般大人700円、中学生250円(都内在住・在学の中学生および小学生以下は無料)という破格の水準を維持しています。さらに、頻繁に訪れる愛好家から圧倒的支持を集めているのが葛西臨海水族園の年間パスポート料金(一般2,800円/65歳以上1,400円)です。年にわずか4回足を運ぶだけで元が取れる計算となり、都市部の大規模水族館としては極めて異例のコストパフォーマンスを誇ります。
入場券の手続きに関しては、現地券売機での当日購入に加え、混雑緩和を目的とした葛西臨海水族園のチケット予約(オンラインQRチケットシステム)が定着しています。特に連休やイベント開催時にはスムーズな入園を果たすための事前確保が推奨されます。また、カレンダー上で見逃せないのが葛西臨海水族園の無料公開日です。「みどりの日(5月4日)」「都民の日(10月1日)」「開園記念日(10月10日)」の年3回は誰でも無料で入園可能となるため、家族連れを中心に園内は最高潮の賑わいを見せます。