観光客の急増は、宮古ブルーと称される美しい海そのものにも変化を迫っている。
橋の橋脚周辺は、潮の流れが複雑に変化するエリアだ。建設当時の徹底した環境配慮工法により、サンゴ礁への直接的な被害は最小限に抑えられたとされていたが、近年の海水温上昇と日焼け止め成分の流入、さらにはマリンアクティビティの激増が重なり、浅瀬のサンゴの白化現象が懸念されている。
現在、地元のダイビングショップやNPO法人が中心となり、橋の周辺海域でサンゴの移植活動や定期的なクリーンアップを実施。「橋のおかげで商売が成り立っているからこそ、その下の海を守る義務がある」と、ボランティアに参加するインストラクターは汗を拭う。2026年からは、環境に優しいサンゴセーフ（特定化学物質不使用）の日焼け止め使用を呼びかける啓発活動が、橋の手前の休憩エリアでも本格化している。
